Wenn die Berliner etwas abgekühlt sind kann man sie füllen. Dafür eignen sich Marmeladen, Pflaumenmus, Erdnussbutter, Nuss-Nougat-Creme, Schokoladenpudding und Vanillepudding. An Fasching werden sie als Scherz auch gerne mit Senf, Ketchup oder ähnlichem gefüllt.